一体化蒸馏仪是由6个单元的加热装置组成的，玻璃蒸馏器皿洗刷仪器时，应首先将手洗净，免得手上的油污附在仪器上，增加洗刷的困难，一般的全玻璃蒸馏器，如烧杯、烧瓶、锥形瓶、试管和量筒等，可以用毛刷从外到里用水刷洗，这样可刷洗掉水可溶性物质、部分不溶性物质和灰尘。若有油污等有氨氮自动蒸馏仪机物，可用一定浓度的洗洁精水溶液浸泡一定时间后，再用蘸有洗涤剂的毛刷擦洗，然后用自来水冲洗干净，再用纯化水润洗内壁2～3次。洗净的玻璃仪器内壁应能被水均匀地润湿而无水的条纹，且不挂水珠。常使用磨口的玻璃仪器，洗刷时应注意保护磨口。 玻璃蒸馏器皿在使用后须立即清洗，针对滤器砂芯中残留的不同沉淀物，采用适当的洗涤剂先溶解砂芯表面沉淀的固体，然后用减压抽洗法反复用洗涤剂把砂芯中残存的沉淀物全部抽洗掉，再用蒸馏水冲洗干净。用来配制、盛放高浓度溶液的带磨口塞的玻璃仪器，如，容量瓶、比色管、滴定管等，用后应及时把溶液倒出，废弃处理或放入试剂瓶中贮存，并及时清洗，以防溶质析出，堵塞磨口塞，损坏玻璃仪器。 玻璃蒸馏器皿清洗步骤，切断电源，关上自来水开关，移下冷凝管，但不需拆下塑料管。小心加入约100ml浓盐酸待横式烧瓶内，与瓶内的水稀释成稀盐酸，如积垢较多，盐酸量可多一些。数分钟后，由水氨氮自动蒸馏仪位器放出，然后用自来水冲洗数次，为了清除微量盐酸，可将烧瓶前后插动使不易清洗的死角也冲洗清洁为止。当再次蒸馏后，开始10分钟内所蒸馏的水，舍去不用。 仪器的清洗，在蒸馏一段时间后，水垢就积聚在横式烧瓶内及石英加热管表面上，这时需要进行清洗，清洗的次数主要视自来水的硬度和使用时间而定，入仪器长时间不进行清洗，要影响蒸馏效果，严重的要损坏加热管，并且清洗时间也要延长。